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簡要描述:單細胞測序核心技術(shù):Rhapsody利用微孔進行單細胞分離,屬于Microwell-seq。 20萬個微孔的尺寸被設(shè)計成一個微孔恰好可以容納一個bead+一個細胞。
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詳細介紹
BD Rhapsody: 單細胞分析工作流程
1. BD Rhapsody 核心技術(shù)之微孔板
一個微孔 = 一個單細胞 + 一個磁珠
BD Rhapsody Express單細胞分析系統(tǒng)提供的單細胞分割,以微孔為基礎(chǔ),功能強大。
● 限度一套臺式設(shè)備,沒有射流泵
● 當細胞在重力作用下沉入微孔時,可以對其進行溫和的處理
● 每個BD Rhapsody微孔板均包括一個超過22萬個分區(qū)的微孔陣列
● BD Rhapsody"微孔板體積約為600μL,稀釋細胞懸浮液可直接裝入微孔板,無需將其濃縮到非常小的體積
● 由于沒有微流通道,因此不需要擔心通道堵塞的問題
● 微孔經(jīng)過特殊處理,以防止細胞粘附在表面,并進行深入的質(zhì)量控制
Rhapsody利用微孔進行單細胞分離,屬于Microwell-seq。 20萬個微孔的尺寸被設(shè)計成一個微孔恰好可以容納一個bead+一個細胞。
2. BD Rhapsody核心技術(shù)之Barcoded Bead
3. 單細胞文庫制備及測序
Single cell isolation and capture流程圖
4. BD Rhapsody技術(shù)優(yōu)勢
成本更低—— 靶向基因檢測,避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù),大大節(jié)省了測序和分析成本。
超高細胞捕獲效率—— 有效細胞捕獲率60%,遠高于市場上目前所有大通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)。
罕見轉(zhuǎn)錄本,更高檢出率—— 靶向定制panel,選定特定基因組合,提高UMI計數(shù)效率,罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低。
克服PCR,擴增偏差——引入單細胞測序金標準,BD分子標簽,降低非特異性表達。
實理更高的分辨率——可以分辨更精細、微觀的細胞群和細胞亞種群。
反轉(zhuǎn)錄的磁珠,超常穩(wěn)存儲——完整cDNA可在磁珠微球結(jié)構(gòu)保存長3月(4度),隨用隨取。
靈活分樣組合——提高樣品通量(最多可12個樣本同時建庫,可等分,可隨機組合);又可以同時進行單細胞蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合檢測,大大降低成本的同時,也為單細胞多組學(xué)研究提供了更高效的平臺。
5. BD Rhapsody產(chǎn)品線overview
單細胞測序核心技術(shù)
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